Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms