Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
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