Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DENRO43583 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DENRO43583 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DENRO43583 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DENRO43583 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms