Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFA2T2O43439 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms