Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTIFO43310 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTIFO43310 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTIFO43310 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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