Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRXO43186 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRXO43186 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRXO43186 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRXO43186 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRXO43186 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRXO43186 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRXO43186 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRXO43186 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRXO43186 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms