Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms