Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP290O15078 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP290O15078 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP290O15078 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP290O15078 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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