Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PODXLO00592 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PODXLO00592 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PODXLO00592 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PODXLO00592 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PODXLO00592 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PODXLO00592 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PODXLO00592 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PODXLO00592 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PODXLO00592 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PODXLO00592 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms