Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms