Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms