Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB5A8MRT5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB5A8MRT5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB5A8MRT5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB5A8MRT5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB5A8MRT5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms