Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NL46 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NL46 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NL46 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NL46 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms