Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms