Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms