Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF583-202ENST00000333201 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 UGT2B4-206ENST00000512583 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PLG-202ENST00000308192 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR10H3-201ENST00000305892 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01929-201ENST00000589125 3067 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms