Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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