Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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