Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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