Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms