Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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FXNQ16595 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FXNQ16595 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FXNQ16595 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FXNQ16595 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FXNQ16595 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FXNQ16595 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FXNQ16595 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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