Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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