Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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IFT88Q13099 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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IFT88Q13099 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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IFT88Q13099 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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