Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MAPK10-378ENST00000642009 2463 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 UGT2B7-203ENST00000508661 1633 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC002480.4-201ENST00000414116 2592 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 THBS3-201ENST00000368378 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 ABCB4-206ENST00000453593 3699 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RP1-206ENST00000636932 3649 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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