Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ACTBP60709 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ACTBP60709 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ACTBP60709 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ACTBP60709 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ACTBP60709 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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