Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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