Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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