Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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