Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CUL3Q13618 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CUL3Q13618 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CUL3Q13618 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CUL3Q13618 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CUL3Q13618 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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