Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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