Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CSNK2A3-201ENST00000528848 1416 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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