Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
GAPVD1Q14C86 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms