Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANK3Q12955 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms