Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA4CQ9C0C4 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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