Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S4R3C0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S4R3C0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S4R3C0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S4R3C0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S4R3C0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S4R3C0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S4R3C0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S4R3C0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms