Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETBP1Q9Y6X0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETBP1Q9Y6X0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETBP1Q9Y6X0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETBP1Q9Y6X0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETBP1Q9Y6X0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms