Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms