Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms