Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms