Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DCAF1Q9Y4B6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
DCAF1Q9Y4B6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms