Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms