Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF330Q9Y3S2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF330Q9Y3S2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms