Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIT1Q9Y2X7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms