Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms