Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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