Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBNO2Q9Y2G9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SBNO2Q9Y2G9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SBNO2Q9Y2G9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBNO2Q9Y2G9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms