Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF6Q9Y252 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms