Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms