Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms