Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARRES3Q9UL19 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARRES3Q9UL19 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms